行政部门:

| 办公室 | 组织人事处（老干部工作办公室）|
| 党群工作部（机关党委、工会、团委）| 监察审计室 | 教务处 |
| 科研处 | 公务员培训处 | 学员工作处 | 研究生部 | 校院工作处 |
| 外事处 | 培训处 | 决策咨询部 | 信息化管理处 | 调研督查处 |
| 后勤保卫处 | 计划财务处 | 校区运行协调办公室 |
| 淀山湖校区管理办公室 | 梅陇校区管理办公室 |
| 上海市习近平新时代中国特色社会主义思想研究中心秘书处|

教研部门:

| 马克思主义学院 | 哲学教研部（当代马克思主义哲学研究所）|
| 经济学教研部（理论经济学研究所）| 科社教研部（当代社会主义研究所）|
| 中共党史教研部 |党的建设教研部（政党研究所）|
| 公共管理教研部（政府研究所） | 社会学教研部（城市社会研究所） |
| 领导科学教研部（人力资源测评中心）|
| 经济管理教研部| 上海发展研究院 |